load H:\Term1\CreditsWorks\Work\1qum.pdb
script load H:\Term1\CreditsWorks\Work\1qum.def
restrict none
background white
echo Protein (chain A) and DNA
restrict *a or dna
backbone 10
select *a
color cpk
select dna
backbone 100
rotate x 80
rotate y 50
pause
echo protein and DNA atoms that midht interact
select within (3.5, dna) and *a
wireframe 70
cpk 130
select within (3.5, *a) and dna
wireframe 70
cpk 130
select 9-12a,35-39a,72a,73a,75a,78a,150-152a,229-231a
wireframe 100
select 905b,906b
color gold
wireframe 10
select 908c,909c,910c
color gold
wireframe 10
select 938d,939d,940d,941d,942d,943d
color gold
wireframe 10
pause
echo connecting atoms
restrict 9-12a,35-39a,72-78a,150-152a,229-231a,905b,906b,908-910c,938-943d
|
←Этот скрипт генерирует три изображения: общее положение всех молекул комплекса белка с лигандом, положение аминокислот, контактирующих с лигандом, и отдельную зону контакта.
|
